Um viele Dateien per ssh zu kopieren, kann man rsync benutzen. z.B:
rsync -az user@remotehostname:/verzeichnis/verzeichnis /lokalesverzeichnis/lokalesverzeichnis

Die Parameter stehen für a=Archiv (div. Optionen gesammelt unter a) und z=zip (Komprimierung).

Rsync fragt dann direkt nach dem Passwort und beginnt damit eine Liste der Dateien zu kopierenden Dateien zusammenzustellen. Danach beginnt erst der Kopiervorgang.